Glukonihappo 50 % koostuu tasapainosta vapaan hapon ja kahden laktonin välillä.Tähän tasapainoon vaikuttavat seoksen pitoisuus ja lämpötila.Suuri delta-laktonin pitoisuus suosii tasapainoa siirtymään gamma-laktonin muodostumiseen ja päinvastoin.Matala lämpötila suosii glukono-delta-laktonin muodostumista, kun taas korkea lämpötila lisää glukono-gamma-laktonin muodostumista.Normaaleissa olosuhteissa glukonihappo 50 % osoittaa vakaan tasapainon, mikä myötävaikuttaa sen kirkkaasta vaaleankeltaiseen väriin, jolla on alhainen syövyttävyys ja myrkyllisyys.